边境牧羊犬又叫西伯利亚雪橇犬，顾名思义，这是一种来自西伯利亚极寒之地的犬种。相传大约三千年前，在西伯利亚东北部的原始部落楚克奇族(Chuckchi)人一直过着半游牧的生活，他们需要一种可以在极低气温下长途跋涉的犬来帮助他们横跨雪漠。关于边境牧羊犬这个名称的来源有两种说法：一种说法是爱斯基摩人的俚语esky——沙哑叫声的意思，因为边境牧羊犬价格的叫声低沉嘶哑，便有了这个奇妙的称号；另一说法则是阿拉斯加淘金客在驾驶雪橇时发出Husky的声音，而给它取了这个名字。　于是，楚克奇人便用一种外行酷似狼的犬种作为最原始的交通工具来拉雪橇，还用来猎取和饲养驯鹿。由于它们体形小巧结实，食量小，无体臭且耐寒，非常适应极地的气候环境，因此而成为楚克奇人的重要财产。这群狗狗被称为西伯利亚楚克奇犬，便是后来边境牧羊犬的祖先。

这种狗首次为外界所知，是在18世纪。当时有艘日本船遇暴风雨漂流至西伯利亚，船员发现了当地土著楚克奇人饲养着这种狗。而后，这群狗狗才随着贸易经商的生意人，被带到不同的地方发展。

而真正让它们一举成名的关键，要追随到1990年初，一个俄国的皮毛商人William Goosak带着一队这种楚克奇族人的狗到了阿拉斯加一个叫“Nome”的小镇，参加当地举办的狗拉雪橇比赛。这些狗卖狗网较当地的土产犬小巧、温顺、不起眼，虽然当地一些犬迷被这个友善的犬种吸引目光，但却没有人真的看好这个陌生犬种，甚至有人戏称它们为“西伯利亚大老鼠”。不过狗主人后来还是说服一个名叫Trustrup的人来驾驶他的雪橇队参赛，最后尽管这之西伯利亚雪橇队伍并没有得到冠军，但是第三名的成绩也是足以让当地人因此刮目相看。

有个名叫查理.福克斯.慕.瑞塞的人在观看了这群边境牧羊犬的优异表现之后，便不惜重金，从西伯利亚引进了70只边境牧羊犬，一口气报名三支队伍参加了1910年的比赛，结果其中一队获得了艰苦的643.72千米比赛的胜利，其他两之队伍也分别获得第二名和第四名。这之后的十年里，边境牧羊犬犬纵横各种大小赛场，赢得了阿拉斯加大部分比赛的胜利。这种楚克奇族人的狗以超快的速度和坚韧的毅力可是被当地的狗拉雪橇爱好者而喜爱。随着它们的优秀表现，这些拥有着小而紧凑身材的美丽犬种开始在阿拉斯加被当地人所认可。

在接着的几十年里，它们在美国十分受欢迎。大约在1960年，它开始被更多的国家如英国所广泛地接受，发展成最具知名度的犬种之一。边境牧羊犬虽然很早就到达了美国，但是美国育犬协会(AKC)却到1930年才正式将边境牧羊犬列入纯种犬行列，并制定了犬种标准。后来一些美国的边境牧羊犬犬友又在1938年成立了美国边境牧羊犬俱乐部(SHCA)，以实际行动来表现对边境牧羊犬的支持。边境牧羊犬在二战时期也因其出色的寻找和营救能力而名噪一时。