藏獒的皮毛：质量比数量更为重要。被毛粗、厚，上层被毛不是很长，冬天有密而卷曲的下层被毛，但其在热季会很稀疏。雄性被毛比雌性显著。被毛不成丝状，不卷曲或成波状。颈和肩被毛厚，外观如斗蓬。尾如刷子，饰毛丰富；后腿上部后侧饰毛丰富。

颜色：艳黑，有或者无棕褐色斑点；蓝色，有或者无棕褐色；金色，从丰富的浅褐色至深红色。所有颜色要尽可能为纯色。棕褐色的范围从艳栗色到很淡的颜色。胸部可以有白点。脚上的白色斑纹要尽可能地小。眼上部、脚较低部位以及尾下侧可以有斑纹。口吻上可有棕褐色斑纹；眼周围可以有明显的斑纹。

各种毛色杂交的可能性
 种公藏獒毛色 种母藏獒毛色 红棕 铁包金 纯黑 狼青 黄 纯白 红棕 红棕、巧克力色 红棕、铁包金 纯黑 狼青、红棕 黄、红棕 红白杂色 铁包金 铁包金、狼青、红棕 铁包金 纯黑、铁包金 铁包金 铁包金、黄 黑白杂色 纯黑 纯黑、红棕 纯黑、铁包金 纯黑 纯黑 琥珀 黑白杂色 狼青 纯黑、狼青 铁包金、狼青 纯黑、狼青 黄、狼青 黄 青白、纯白 黄 黄、狼青、红棕 铁包金、黄 纯黑、狼青 黄、狼青 黄 土黄、淡黄 纯白 红白杂色 黑白杂色 黑白杂色 青灰、纯白 土黄、淡黄 纯白

在毛色搭配组合中最困难的是纯白色。除纯白色公犬与纯白色母犬交配，可以获得品质纯正的白色个体外，白色与其他毛色的搭配，后代基本都是杂色，因之也更体现纯白色藏獒的珍稀和名贵。

狼青色藏獒在草原上的数量正在逐渐增加。在多种毛色的交配组合中，都出现了狼青色。这种毛色毛纤维基部是青灰偏白色，而毛纤维上端又偏黑色。视公母藏獒毛色又有所区别，间或附带有黄色、黑色等。例如红棕色公藏獒与纯黑色、四眼毛色和狼青色母藏獒交配，都有狼青色。说明决定以上毛色的等位基因之间都存在着无显性的关系，或不完全显性的关系。而狼青色藏獒除该毛色特征外，尚具有体型高大、性情凶猛的特点，十分为藏民群众所喜爱。